Hijo de Hermes y Afrodita.
El mito cuenta que Afrodita se sintió culpable del adulterio cometido y dejó a su hijo en Ida, al cuidado de las ninfas. Se convirtió en un joven de gran belleza que quería conocer el mundo. Se encaminó a Caria y en Helicarnaso, se detuvo en un pozo para refrescarse.
Sin advertir que era observado por la náyade Salmacis , se sumergió desnudo en las aguas del lago. La náyade se enamoró inmediatamente de él y se lanzó al lago en busca de él. Fue rechazada por Hemafrodito, pero ésta no se rindió y aferrándose a su cuerpo, pidió a los dioses que nunca los separaran. Lo dioses cumplieron su deseo y formaron una persona con doble sexo.
Hemafrodito al ver su destino, pidió a los dioses que todo aquel que se bañara en aquel lago, tuviera su mismo destino